1. Mendampingi masyarakat dalam mengembangkan sumber daya alam dan sumber daya manusia baik secara perorangan maupun kelompok dalam usaha meningkatkan taraf hidup, kesejahteraan sosial dan martabat dalam pembangunan berkelanjutan yang berwawasan lingkungan.
2. Meneguhkan dan memperkuat partisipasi masyarakat marginal dalam memecahkan masalah-masalah yang dihadapi.

Strategi:

1. Mewujudkan lembaga yang demokratis, mandiri dan profesional sebagai penggerak demokratis, ekonomi rakyat dan politik.
2. Membangun aliansi strategis dalam rangka memperkuat posisi tawar politik masyarakat marjinal.
3. Mengembangkan jaringan kerjasama dengan semua pihak yang bekerja dalam bidang sosial, ekonomi, pertanian, gender, dan lingkungan, pada tingkat regional, nasional, dan internasional.
4. Membela, memberdayakan dan memperjuangkan hak ekonomi, sosial dan budaya masyarakat marjinal.
5. Membangun organisasi rakyat yang kuat dan mandiri.

Hasil dari Strategic Planning Yayasan BITRA Indonesia Januari 2009 di Training Center Sayun Sabah (TCSS) untuk program strategis tahun 2009 - 2014, dihasilkan program strategis yang akan dijalankan selama 5 tahun ini, yakni:

PROGRAM STRATEGIS:

1.   Pengembangan pemasaran produk pertanian

2.   Sinergi BPR, Fpera/CU dan KPBUT

3.    Pendayagunaan radio komunitas untuk transformasi sosial

(Meningkatnya kapasitas SDM untuk perencanaan dan pengelolan radio komunitas)

4.    Pertanian organik terpadu dengan peternakan

(Petani sudah menerapkan sistem pertanian terintegrasi, termasuk ternak)

5.    Membangun gerakan politik pada tingkat desa

6.   Konservasi daerah tangkapan air

7.   Penguatan strategi pendampingan

8.      Pendampingan dan ’pelepasan’ OR yg mandiri

(Sebagian OR menjadi mandiri BITRA menjadi konsultan).